De nos jours, ses fruits sont utilisés pour leurs bienfaits sur l’appareil digestif. Leurs propriétés sont dues à l'huile essentielle qu'ils contiennent. Capable de stimuler la digestion, le fenouil limite les sensations de ballonnements. Il est notamment reconnu pour soutenir l'appétit, la digestion, l'élimination, la santé du tube digestif, et contribuer à des fonctions d'élimination urinaire (pour une dose de 0,2 à 5g/j poudre).

Le fenouil peut se consommer dans la cuisine de tous les jours pour parfumer les plats. Il se trouve également sous forme de compléments alimentaires ou dans des infusions.